Lãnh đạo Khoa gồm 01 Trưởng khoa, 02 Phó trưởng khoa; 04 tổ bộ môn: Tổ toán, tổ Lý, tổ Hóa, tổ Sinh – Môi trường; và tổng số cán bộ, viên chức toàn khoa có 30 người trong đó trình độ tiến sĩ: 05, nghiên cứu sinh: 03, thạc sĩ: 19, cử nhân: 03.

Các giảng viên của khoa đều được đào tạo tại các trường, viện, trung tâm khoa học lớn trong và ngoài nước, đã thể hiện vai trò tiên phong trong việc giảng dạy, nghiên cứu và hướng dẫn sinh viên nghiên cứu khoa học, nâng cao trình độ chuyên môn, nghiệp vụ, cập nhật kiến thức khoa học tiên tiến, tham gia nghiên cứu nhiều đề tài khoa học cơ bản và ứng dụng, viết bài cho các tạp chí khoa học, tham gia các hội nghị khoa học hàng đầu về lĩnh vực chuyên môn trong nước và quốc tế. Cán bộ - giảng viên khoa Khoa học tự nhiên là những người năng động, nhiệt tình trong giảng dạy và trong các công việc gắn liền với hoạt động sản xuất, kinh doanh trong thực tế, sẽ là lực lượng đáng tin cậy chấp cánh ước mơ khoa học cho thế hệ trẻ đến với trường Đại học Phú Yên.